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GB/T 39650-2020

基本信息

标准号: GB/T 39650-2020

中文名称:实验动物 小鼠、大鼠品系命名规则

标准类别:国家标准(GB)

标准状态:现行

出版语种:简体中文

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相关标签: 实验 动物 小鼠 规则

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标准简介

GB/T 39650-2020.Laboratory animal-Rules for nomenclature of mouse and rat strains.
1范围
GB/T 39650规定了实验动物小鼠、大鼠品系的命名规则,包括实验动物遗传学分类,实验室代码,近交系、多种来源近交系、同源突变近交系、同源导人近交系和分离近交系的命名,封闭群(远交群)和杂交群的命名。
GB/T 39650适用于实验动物小鼠、大鼠品系命名。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB 14923实验动物哺乳类实验动物的遗传质量控制
3术语和定义
GB 14923界定的以及下列术语和定义适用于本文件。
3.1
分离近交系 segregating inbred strains
通过近交培育(通常是兄妹交配)每代都进行杂合性筛选分离近交系,使某一特定等位基因或突变保持着杂合状态的近交系。
3.2
协同杂交系 collaborative cross strains ;CC;GC
含有来自8个祖系(A/J、C57BL/6J.129S1/SvImJ、NOD/ShiLtJ. NZ/HILtJ、CAST/EiJ、PWK/PhJ和WSB/EiJ)的遗传基因。采用漏斗育种策略,将所有8个祖系纳人3个繁殖种群中,连续数代兄妹交配而得的多亲代重组近交系。
4实验动物 遗传学分类
按实验动物培育方式和遗传特点的不同,分类如下。.
a) 近交系inbred strains :
1) 重组近交系recombinant inbred strains,RI;
2)重组同类系recombinant congenic strains, RC;
3)协同杂交系collaborative cross strains,CC,GC;
4) 混合系mixed inbred strains ,MI;

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标准内容

ICS65.020.30
中华人民共和国国家标准
GB/T39650—2020
实验动物
小鼠、大鼠品系命名规则
Laboratory animalRules for nomenclature of mouse and rat strains2020-12-14发布
国家市场监督管理总局
国家标准化管理委员会
2020-12-14实施
本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则起草本标准由全国实验动物标准化技术委员会(SAC/TC281)提出并归口。GB/T39650—2020
本标准起草单位:中国医学科学院医学实验动物研究所、中国食品药品检定研究院、山东省实验动物中心、西安交通大学、北京积水潭医院、中国疾病预防控制中心实验动物中心、复旦大学附属上海市公共卫生临床中心、中国疾病预防控制中心职业卫生与中毒控制所、中国疾病预防控制中心营养与健康所。
本标准主要起草人:秦川、孔琪、岳秉飞、魏强、金东庆、刘恩岐、赵丹慧、高虹、卢选成、周晓辉、李军延、王竹、邵奇鸣、向志光
GB/T39650—2020
实验动物小鼠、大鼠品系繁多,来源于世界各地不同的实验室,遗传背景差异较大。各种小鼠、大鼠品系的规范化命名,对于在世界范围内培育和使用这些小鼠、大鼠非常重要。尤其是同种品系个体之间也存在遗传漂变的可能性,不同实验室培育的同种品系也应加以区别。本标准参考国际小鼠标准化遗传命名委员会(InternationalCommitteeonStandardizedGeneticNomenclatureforMice)制定的《小鼠、大鼠品系命名指南》(2016年1月修订版)编制而成。1范围
实验动物
小鼠、大鼠品系命名规则
GB/T39650—2020
本标准规定了实验动物小鼠、大鼠品系的命名规则,包括实验动物遗传学分类,实验室代码,近交系、多种来源近交系、同源突变近交系、同源导入近交系和分离近交系的命名,封闭群(远交群)和杂交群的命名。
本标准适用于实验动物小鼠、大鼠品系命名。规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。GB14923实验动物哺乳类实验动物的遗传质量控制术语和定义
GB14923界定的以及下列术语和定义适用于本文件。3.1
segregatinginbred strains
分离近交系
通过近交培育(通常是兄妹交配)每代都进行杂合性筛选分离近交系,使某一特定等位基因或突变保持着杂合状态的近交系。
协同杂交系
collaborativecrossstrains;CC;GC含有来自8个祖系(A/J、C57BL/6J、129S1/SvImJ、NOD/ShiLtJ、NZ/HILtJ、CAST/Ei、PWK/PhJ和WSB/EiJ)的遗传基因。采用漏斗育种策略,将所有8个祖系纳人3个繁殖种群中,连续数代兄妹交配而得的多亲代重组近交系。实验动物遗传学分类
按实验动物培育方式和遗传特点的不同,分类如下。a)近交系inbred strains:
重组近交系recombinantinbredstrains,RI;重组同类系
recombinant congenic strains,RC;协同杂交系collaborativecross strains,CC,GC;混合系mixedinbred strains,MI;互交系advanced intercross lines,AIL;同源突变近交系coisogenicinbredstrains;同源导人近交系(同类近交系)congenicinbredstrains;染色体置换系consomicstrainsorchromosomesubstitutionstrains;1
GB/T39650—2020
分离近交系segregating inbred strains;核转移系conplasticstrains;
11)遗传修饰动物geneticallymodifiedanimalsb)
封闭群(远交群)closedcolony(outbredstock)。杂交群hybrids。
5实验室代码
5.1实验室代码是实验小鼠、大鼠品系命名的一个关键要素。将实验室代码作为实验小鼠、大鼠品系命名的后缀,可区别不同实验室拥有的小鼠、大鼠品系,尤其是品系下属的亚系。5.2存在不同形式的同源导人近交系和其他品系也可采用实验室代码表示。5.3实验室代码用于标识培育和拥有某个小鼠或大鼠品系的特定研究机构、实验室或研究人员。编码规则可为研究机构、实验室或研究人员英文名称的缩写,由1~4个英文字母(首字母大写,其余均小写)组成,需要通过专业机构认定并国际互认,避免重复或混淆。国外实验室代码应采用实验动物资源研究所(ILAR)分配的代码,示例见表1。表1国外实验室代码示例
实验室代码
英文名称
The Jackson Laboratory
W.L. and L.B, Russell
JohnRapp
Medical College of WisconsinKyoto University
中文名称
美国杰克逊研究所
罗素(研究人员)
约翰拉普(研究人员)
美国威斯康星医学院
日本京都大学
示例:C57BL/6J小鼠,6J中的J=Jackson(TheJacksonLaboratory)。注:国外实验室代码数据库地址:https://nationalacademies.org/ilar/lab-code-database。国内实验室代码应采用中国实验动物学会(CALAS)分配的代码,示例见表2,可在ILAR备案。表2国内实验室代码示例
实验室代码
英文名称
Institute of Laboratory
Animal Science,
Chinese Academy of Medical Sciences (CAMS)Institute of Zoology,Chinese Academy of Sciences免费标准bzxz.net
National Institutefor Food and Drug ControlPeking University
Beijing HFK Bioscience Co. LtdSG
中文名称
中国医学科学院医学实验动物研究所中国科学院动物研究所
中国食品药品检定研究院
北京大学
北京华阜康生物科技股份有限公司6
近交系的命名
基本原则
GB/T39650—2020
6.1.1近交系命名应采用一个独特简短符号来命名,由天写字母或数字或天写字母与数字组合(宜以大写字母开头)组成。近交系命名示例见表3。表3近交系的命名示例
命名方式
大写字母
单独数字
大写字母与数字组合
小鼠品系
大鼠品系
小鼠品系
大鼠品系
小鼠品系
大鼠品系
品系举例
AKR.NZBNZC,NZO
C3H.C57BL
6.1.2小鼠、大鼠品系命名应避免重复,如有命名相似的品系应加以区别于20代前分支出去,亲缘关系密切者可相近命名,示例见表4。6.1.3
表4亲缘关系密切者命名示例
小鼠品系
NEB.NEC.NZO
品系举例
6.1.4近交代数用“F”和代数表示,可加括号置于品系名称后面。品系名称加代数的表示示例见表5。表5品系名称加代数的表示示例
小鼠品系
大鼠品系
A/J(F150)
ACI/N(F159)
品系举例
总近交代数信息缺失时,若已知最新近交代数最小值,也可通过先后写上问号和已知后续近交代数来表示。总近交代数信息缺失时命名示例见表6。表6
小鼠品系
亚系的命名
总近交代数信息缺失时命名示例品系举例
C3H/HeJ-ruf(F?+25)
在原亲代品系符号后面加一条斜线,后面是亚系名称。亚系命名可采用以下方法:
GB/T39650—2020
数字,如小鼠品系FL/1ReFL/2Re;a)
实验室代码,通常第一字母为大写,其余小写,如A/He,表示小鼠品系A的Heston亚系;b)
CBA/J,表示小鼠品系CBA的Jackson实验室亚系:c)
数字及实验室代码混合:当实验人员或实验室发展出一种以上的亚株时,可加数字以示区别,如小鼠品系FL/1Re,FL/4Re
6.2.3亚系名称通常是最初培育该品系的人员或实验室代码。在某实验室培育多个亚系时应在实验室代码后加序列号以示区别。
6.2.4在亚系基础上再形成分支时,可在亚系名称后面加新亚系名称,但不加斜线。6.2.5出版物中首次提及品系名称时应使用全称,之后可使用缩写。6.3其他情况
国际上已公认的品系名称,可不符合6.1、6.2规定。示例:小鼠品系“129P1/J”。
7多种来源近交系的命名
7.1重组近交系
7.1.1两个原始(亲代)近交系的一个或两个大写字母缩写,中间应加上大写“X”,字母与X之间无空格。雌(母)系在前,雄(父)系在后,示例见表7。表7重组近交系的命名示例(1)——常规命名名称
由BALB/c(雌)及C57BL/6J(雄)杂交而得的小鼠重组近交系7.1.2涉及两个相同品系的重组近交系,所有成员应连续编号。顺序号可从小鼠基因组数据库(MGD)获取。来源于相同祖先的多种重组近交系也应赋予顺序号,示例见表8。表8重组近交系的命名示例(2)——相同品系来源名称
BXD1.BXD2.BXD3
HXB1.HXB2.HXB3
来源于C57BL/6×DBA/2杂交形成的小鼠重组近交系,属于BXD系列来源于SHR/Olalpcv×BN-Lr/Cub杂交形成的大鼠重组近交系,属于HXB系列7.1.3如第二个品系的缩写以数字结尾(如CX8),应用连字号“”将其与序列号隔开(如CX8-1),以免混淆,示例见表9。
表9重组近交系的命名示例(3)—数字结尾名称
(BXD1/TyXAXBI9/Pgn)FI
BXD1/Ty雌性鼠和AXB19/Pgn雄性鼠杂交一代7.1.4与某一亲代品系回交培育出的重组同类系,应相应命名。7.1.5为了阐明复杂性状,可对重组近交系进行互交。这些F1代可称作重组近交互交系(RIX),应采用与其他近交品系间F1相同的命名方法4
2协同杂交系
GB/T39650—2020
7.2.1协同杂交系的命名应以“CC”开头,接着是一个4位数,一条斜线,最后是培育该品系的实验室代码。对于其他近交系,建立亚系时应附上额外的实验室代码,示例见表10。表10协同杂交系小鼠命名示例
CC0058/Unc
0058号协同杂交小鼠,由北卡罗来纳大学培育而成7.2.2为阐明复杂性状,可对协同杂交(CC)系进行互交。这些F1代被称作重组近交互交系(RIX),可采用与其他近交品系间F1代相同方法的命名,示例见表11。表11重组近交互交系示例
(CC0012/UncXCC2134/Geni)Fl
7.3混合系
CC0012/Unc雌性小鼠和CC2134/Geni雄性小鼠杂交一代7.3.1来源于最多3个亲代品系的初始群或近交系,应以这3个品系的大小字母缩写命名,并用分号隔开。相关品系存在供体/宿主关系时,第一个分号前的品系名称应为宿主,分号后的品系名称为供体,对于供体为ES细胞系的目标突变应按此规则命名,示例见表12。表12混合系的命名示例(1)——常规命名名称
B6;129-Acr2tm1Zuk
B6Brd;B6Dnk;
B6N-Tyre-BrdJph3tmla
(KOMP)Wtsi/Mbp
个来自C57BL/6J和129ES细胞系携带定向靶基因敲除Acur2基因的混合系个携带有靶突变jph3基因的混合系。该混合系来自:C57BL/6Brd-Tyrc-Brd,C57BL/6Dnk和C57BL/6N小鼠:由小鼠生物项目UCD(Mbp)保持7.3.2缩写顺序可依据主要贡献品系或字母、数字顺序。7.3.3应使用实验室代码和序列号来区分不同实验室培育的品系,或者同一实验室培育的多种品系。7.3.4在未完全近交前,这些命名可能会被用于混合系。在认定为近交系时,应标注近交代数(如>F20)7.3.5来源于3个以上祖系的或拥有未知来源遗传的突变系,原品系或近交系,被认为是一种“混合”近交系时,可命名成STOCK,空一格,无连接符,加上其所携带的突变或染色体异常,示例见表13。一未知来源
表13混合系的命名示例(2)—
STOCKRb(16.17)5Bnr
-个近交系,来自未知或复杂的遗传背景,携带罗伯逊易位的Rb(16.17)5Bmr基因混合系达到近交状态时,应给予恰当的命名,7.3.6
如符号短,应以其所携带的基因突变的符号进行命名,所有字母应大写,示例见表14。5
GB/T39650—2020
JIGR/Dn
表14混合系的命名示例(3)一
基因突变
个近交系,来自携带突变gr(灰色)和ji(jittery)等位基因的混合系7.3.8如通过将携带突变的动物与每一代或隔代F1杂交群杂交来维持突变等位基因或者染色体异常,则用该F1所用符号对该种群进行命名,但不需要“F1”后缀,采用恰当的等位基因或染色体异常符号,示例见表15。
混合系的命名示例(4)一
B6C3Fea/a-Dh
重组同类系
杂交群
DH(显性半肢畸形)突变小鼠品系,通过每代跟(B6C3Fea/a)F1代杂交而得,但该品系本身不是F1代
该近交系含分散供体纯合子片段和受体基因组:供体基因组的数量取决于原始回交的次数,F2代回交一般为12.5%。
7.4.2当理论近交系数接近于标准近交系的数值时,RC品系应当被视作完全近交系。7.4.3
回交F1代应被视作等同于兄妹交配的F2代7.4.4两次回交(N3,等价于F6),再接14代兄妹交配(F14)培育的品系可视为完全近交系,示例见表16。
表16重组同类系的命名示例
个来自BALB/c受体和STS供体的小鼠重组近交系7.4.5RC品系应采用两个近交系的大写字母缩写来命名,受体在前,并用小写字母“c”隔开。来源于相同祖系的多RC品系被赋予序列号,例如CcS1、CcS2、CcS3等如第二个品系的缩写以数字结尾(如129P2),应使用连接符来将其与序列号隔开。7.4.6
互交系
先建立2个近交系的F2代,然后与各自的后代互交来培育获得,但要避免同胞交配。7.5.2互交系命名中应包括培育该品系的实验室代码、冒号,以及分号隔开的两个近交系缩写.代数写在连接符后面。代数可表示为G3、G4等,以F2代后的首次非同胞杂交开头,示例见表17。表17互交系的命名示例
Pri:B6.D2-G#
一个普林斯顿大学制作的AIL品系,由C57BL/6×DBA/2交配而得。G数将随着每一代的增加而增加
8同源突变近交系、同源导入近交系和分离近交系的命名8.1同源突变近交系
GB/T39650—2020
8.1.1同源突变近交系应以品系符号,必要时以亚系符号,接一个连接符以及斜体的差异等位基因符号来表示,示例见表18。
表18同源突变近交系的命名示例(1)一—常规命名名称
129S7/SvEvBrd-Fyntm150om
有Fyn靶基因突变的小鼠品系,使用来自129S7/SvEvBrd小鼠的AB1ES细胞系嵌合体动物和129S7/SvEvBrd小鼠交配,随后保持该同源突变品系8.1.2当同源突变维持在杂合状态时,应以品系符号接一个连接符以及斜体的等位基因和上标的表型来命名,示例见表19。
表19同源突变近交系的命名示例(2)—杂合状态名称
C57BL/6J-Aqp2cm
先天性肾积水基因突变小鼠品系,C57BL/6J小鼠在AgP2基因位点携带自发突变导致先天性进行性肾积水(cph)。一个同源突变品系,纯合子小鼠不能存活,需要以Aqp2*m/+×Aqp2rm/+杂合子状态保存8.1.3如知道同源突变系发生突变之后的近交代数,应在突变的代数后以加号“十”连接突变后的繁殖代数,如F110+F23:表示于110代发生突变后,以兄娣交配至23代。8.2同源导入近交系
8.2.1在最先的出版物中描述快速同源导人系时,应包含代数,以及用于确定品系同类性的标记的基因组间距。
8.2.2同源导人近交系采用含三部分内容的符号命名。在背景品系(backgroundstrain)名称后应加上提供品系(donorstrain)名称,二者间以“.”区隔,于提供品系名称的后位加上其所提供的基因符号,其间以连字号”加以分隔。例如:B10.129-H12b-)C57BL/10的小鼠上接有一段由129/J来的基因H12b。大鼠同源导人近交系的命名与同源突变近交系相似,如LEW/N-rnu:如为异质体状态存在则需加上一斜线及“+”号,如LEW/N-rnu/+。8.2.3对于发生了突变的染色体未知的情况,包括供体未近交,或复杂的,或是一个F1杂种,应当使用Cg符号来表示这种复杂的遗传起源。供体符号或Cg的使用对于区分同源导入系和同源突变系非常重要。Cg也应用于表示通过共同杂交两个同源导人系而培育的品系,这两个同源导入系已经分别与同一宿主背景回交,但它们的各自供体存在差异。Cg还应用于来源于单个供体的等位基因的情况,但同源导人系也携带其他同源突变等位基因。在句点后C作为供体使用,表明品系名字中的多个等位基因有多个来源,或者表明品系名字中至少有一个等位基因的遗传起源未知,示例见表20。GB/T39650—2020
B6.AKR-H2
SHR.BN-RT
ACIBUF-Pur1/Mna
B6.Cg-KiwGpil*
0同源导入近交系的命名示例(1)一释义
一常规命名
个带有C57BL/6遗传背景的小鼠品系,从AKR/I小鼠品系中引人了H2*等位基因个带有SHR遗传背景的大鼠品系,从BN大鼠品系中引人了RT1”基因片段一个带有ACI遗传背景的大鼠品系,从BUF大鼠品系中引人了Pur1数量性状基因座基因片段
个带有C57BL/6遗传背景的小鼠品系,供体品系是混交系,带有C3H/HeJ小鼠品系的Kit等位基因和CAST/Ei小鼠品系的Gpil等位基因8.2.4如可获得来源于相同宿主背景与供体的几个品系,且它们携带相同的差异等位基因,那么这些个体品系用斜线加序列号和实验室代码的方式区分,示例见表21。表21来源于相同宿主背景与供体的几个品系命名示例名称
C.B10-H2b/1Sn
C.B10-H2*/2Sn
来自实验室代码为\Sn”的1号C.B10-H2\品系来自实验室代码为\Sn\的2号C.B10-H2品系8.2.5可使用括号来表示某一近交系、初始同源导入或同源导入近交系可能具有来自指定宿主背景和供体之外的较小的遗传贡献率,8.2.6对于单个附加品系的贡献,可在近交系或同源导入系名字后加括号,里面写上该品系缩写。多个、混合或未知附加品系的贡献应以Cg加括号来标识。若供体用Cg表示,则可不附加信息,示例见表22。
同源导入近交系的命名示例(2)名称
B6(C)-mut
B6(Cg)-mut
C.129P(B6)-I12mHm
-附加品系
突变来自一个近交系(例如,C57BL/6J),跟另一个近交系(例如,BALB/c)杂交,然后跟原始品系回交
突变来自C57BL/6,杂交到混合或不明背景的小鼠品系然后跟原始的C57BL/6品系回交
129ES细胞系靶突变,转移到带有B6129P遗传背景的BALB/c小鼠8.2.7若已经转移的染色体片段可用几个基因或多个DNA位点界定,那么列出被证明存在于括号内染色体片段中的最近处和最远处的标记,应以此界定该片段,并用连接符隔开示例见表23。表23
B6.Cg-(D4Mit25-D4Mi180)/Lt
同源导入近交系的命名示例(3)一一DNA位点界定
个同源导入近交系,将一段来自封闭群或混合系小鼠(一Cg)的4号染色体导入C57BL/6J小鼠,两端做标记B6.CBA-(D4Mit25-D4Mit80)/Lt8
一个类似的同源导人近交系,供体染色体片段来自CBA品系GB/T39650—2020
8.2.8界定该片段的标记仅是经过检测的最近处和最远处的标记,这并不意味着更近处或更远处不存在未经检测的其他标记。若同一或不同实验室培养了含有相同片段的多个品系,则应按顺序标上斜线、序列号和实验室代码,否则无法区分。8.2.9在同源导人近交系名称后,以N及数字表示回交代数,如N10F6->回交10代后再以兄妹交配6代,另较复杂的交配其代数应以NE(Nequivalent)及数字表示,如NElo,表示当隐性基因回交到近交背景系时,经过10轮的回交和互交来恢复纯合子,用于下一次回交(20代)。当通过回交后的兄妹交配来维持同源导入系,兄妹交配的代数写在回交代数之后,例如N10F6,10代回交接着6代兄妹近交;NE12F17,遗传上等同于12代回交的一个回交与互交的复杂体系,接下来是17代的兄妹交配。当培育中快速同源导人系N最初将小于10时,在N之后括号写出实际代数,例如N(6)。8.3染色体置换系(同染色体型系)8.3.1通过将一整条染色体不断回交到一个近交系培育而成。与同源导入系一样,至少需要10代回交,F1代视为第1代。对于常染色体,有必要分析后代的基因型来确保所选的供体染色体未与相应的受体染色体发生重组。
8.3.2染色体置换系的命名方法为HOSTSTRAIN-Chr#DONORSTRAIN,如C57BL/6J-Chr19SPR为M.spretus的第19染色体回交于B6的染色体置换系,示例见表24。表24染色体置换系的命名示例
SHR-ChrYBN
C57BL/6J-Chr19SPR
C57BL/6J-Chr/A/ Chr 3DBA/2
这个染色体置换大鼠品系,从BN大鼠的Y染色体回交到SHR大鼠而得这个染色体置换小鼠品系,M.spretus小鼠9号染色体回交到C57BL/6J小鼠而得这个染色体置换小鼠品系,A/J小鼠1号染色体和DBA/2J小鼠3号染色体回交到C57BL/6J小鼠而得
8.3.3有时不可能将整条染色体从一个品系转移到另一品系,原因是某一特定染色体上的致死效应。例如:PWD/Ph个体染色体被转移到C57BL/6J品系的一个同染色体型集揭示,Chr11和ChrX不能被完整地转移。
8.3.4为了对促成同染色体型集的被转移的染色体“段”命名,该区域可表示成十进制1、2、3等。因此,这个同染色体型集的Chr11的一部分可为:C57BL/6J-Chr11.1PWD/Ph/ForeJ。8.3.5尽管同染色体型品系在概念和培育方法上与同源导入品系相似,在同染色体型命名时,宿主系的名学不宜缩写,也不要求供体放在句点后面,原始品系应以上标表示。8.3.6上标中的所有字母大写,染色体字母/数字以及上标非斜体,这样能区分染色体标识符和等位基因符号。
8.4分离近交系
8.4.1分离近交系的命名与其他近交系相似,分离基因位点是该品系标准基因型的一部分(见8.1)。8.4.2当分离被毛颜色等位基因是近交系正常表型的一部分时,品系名称中不需要写人它们,示例见表25。
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