基本信息
标准号:
SN/T 4876.1-2017
中文名称:DNA条形码方法第1部分:检疫性乳白蚁
标准类别:商检行业标准(SN)
标准状态:现行
出版语种:简体中文
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相关标签:
DNA
条形码
方法
检疫
白蚁
标准分类号
关联标准
出版信息
相关单位信息
标准简介
SN/T 4876.1-2017.DNA barcode-Part 1 :Quarantine Coptotermes spp.
1范围
SN/T 4876.1规定了我国检疫性乳白蚁的DNA条形码检测方法。
SN/T 4876.1适用于我国进境植物检疫性乳白蚁DNA条形码的测定、结果的比对分析与判定。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
SN/T 1105大家白蚁检疫鉴定方法
3术语 和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1DNA条形码DNA barcodes
一段短的、标准化的基因片段,用于区分不同的物种。该片段在种间存在明显的遗传变异和分化并容易进行PCR扩增。DNA条形码技术主要用于物种识别和新种发现。
3.2凭证标本voucher specimens
DNA条形码的实物参考凭证,凭证标本信息包括馆藏信息、采集信息、鉴定信息,用于复核。模式标本是用于分类学研究的凭证标本。
3.3COIl基因
线粒体基因组的蛋白质编码基因,全称为细胞色素c氧化酶亚基II (cytochrome c oxidase subunit II),由于该基因进化速率较快,常用于分析亲缘关系密切的种、亚种及地理种群之间的系统关系。
标准内容
SN/T4876.1—2017 DNA条形码方法 第1部分:检疫性乳白蚁
前言
本部分为SN/T4876《DNA条形码方法》系列标准的第1部分。本部分按照GB/T 1.1—2009给出的规则起草。请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任。本部分由国家认证认可监督管理委员会提出并归口。本部分起草单位:中华人民共和国珠海出入境检验检疫局,中华人民共和国江苏出入境检验检疫局、中华人民共和国深圳出入境检验检疫局、中华人民共和国湖北出入境检验检疫局。本部分主要起草人:张卫东、权永兵、许彩芸、钱路、黄永辉、迟远丽、徐浪、廖力、徐森锋、余道坚、安榆林、王振华。
1 范围
SN/T4876的本部分规定了我国检疫性乳白蚁的DNA条形码检测方法。本部分适用于我国进境植物检疫性乳白蚁DNA条形码的测定、结果的比对分析与判定。
2 规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。SN/T1105 大家白蚁检疫鉴定方法。
3 术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1 DNA条形码 (DNA barcodes):一段短的、标准化的基因片段,用于区分不同的物种。该片段在种间存在明显的遗传变异和分化并容易进行PCR扩增。DNA条形码技术主要用于物种识别和新种发现。
3.2 凭证标本 (voucher specimens):DNA条形码的实物参考凭证,凭证标本信息包括馆藏信息、采集信息、鉴定信息,用于复核。模式标本是用于分类学研究的凭证标本。
3.3 COI基因:线粒体基因组的蛋白质编码基因,全称为细胞色素c氧化酶亚基I (cytochrome c oxidase subunit I),由于该基因进化速率较快,常用于分析亲缘关系密切的种、亚种及地理种群之间的系统关系。
4 乳白蚁基本信息
中文名称:乳白蚁
学名:Coptotermes spp.
分类地位:等翅目 Isoptera,鼻白蚁科 Rhinotermitidae,乳白蚁属 Coptotermes Wasmann。乳白蚁属是世界性的重要害虫种之一,目前全世界有效定名的乳白蚁近70种。主要危害房屋建筑中的木结构,也危害埋地塑料和绿化树木。乳白蚁近距离传播靠成虫飞行扩散,远距离传播主要借助于原木、板材、木方及木质包装等铺垫材料等扩散。
5 方法原理
根据乳白蚁的COI序列特征,应用DNA条形码技术对乳白蚁进行鉴定。
6 仪器设备、用具及试剂
6.1 仪器设备与用具
常规PCR仪、微量分光光度计、电泳仪、凝胶成像系统、酸度计、测序仪、高速冷冻离心机、生物安全柜、烘箱、高压灭菌锅、解剖镜、天平、摇床、水浴锅、制冰机、纯水仪、旋涡震荡器、-70℃冰箱、冰箱、微量移液器(0.5μL, 2μL, 10μL, 20μL, 100μL, 200μL, 1000μL)、PCR反应管(0.2mL, 0.5mL)。
6.2 试剂
除另有规定外,所有试剂均为分析纯或生化试剂。提取液(含1% SDS、50mmol/L Tris-HCl、25mmol/L NaCl、25mmol/L EDTA)、3mmol/L KOAc (pH 7.2)、Tris饱和酚、蛋白酶K、氰仿、异戊醇、异丙醇、75%乙醇、无水乙醇、RNase A、10×PCR缓冲液、DL2000 Marker、琼脂糖、溴化乙锭、脱氧核糖核苷三磷酸(dNTPs)、Tag DNA聚合酶、引物(见表1)、EB缓冲液。
表1 扩增引物
目标基因:COI
引物:TY-F (5'-GTGCATTAAGC-3'), TY-R (5'-CTTGCTTTCAGTCATCTGATG-3')
扩增片段大小/bp:763
7 DNA条形码鉴定
7.1 样品的处理
样品的处理见SN/T1105。尽可能选择新鲜标本,标本保存于无水乙醇中,每份标本单管保存,并做好唯一性标识。
7.2 核酸的制备
取白蚁于双蒸水中漂洗,吸水纸吸干,解剖镜下剔除腹部,取胸部肌肉和足置于1.5mL Eppendorf管中,加入40μL提取液(含1% SDS、50mmol/L Tris·HCl、25mmol/L NaCl、25mmol/L EDTA),放置于-70℃冰箱中,4min后取出,用牙签捣碎,勾浆,加入等体积的3mmol/L...
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