ICS13.020.01
CCSZ 01
DB
北京市地
方
标准
DB11/T2023—2022
鱼类贝类环境DNA识别技术规范
Technical regulations for fish and shellfish identification usingenvironmental DNA
地方标准信息服务平台
2022-09-29发布
北京市市场监督管理局
2023-01-01实施
发布
前言:
1
范围.
2规范性引用文件
3术语和定义
4
鱼类贝类eDNA识别程序
5试剂和器具,
水样采集.
6
7
水样富集
8DNA提取和纯化
9
PCR扩增
测序及结果分析
10
11
质量保证与质量控制,
附录A
(资料性)
参考文献.
8碱基条形码参考序列
目
次
DBI1/T2023—2022
2
2
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5
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8
9
10
地方标准信息服务平台
草。
前言
DBI1/T2023—2022
本文件按照GB/T1.1一2020《标准化工作导则第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定起本文件由北京市水务局提出并归口。本文件由北京市水务局组织实施。本文件起草单位:北京市水文总站(北京市水务局水质水生态监测中心)、中国科学院生态环境研究中心、首都师范大学。
本文件主要起草人:黄振芳、刘波、杨蓉、李世国、王忠锁、王东霞、徐斌、赵红磊、叶燕慧、郭伟、徐冉、唐女、孙春媛、张满富、吕喆、王浩、王玉播、吴玉梅、王雪莲、刘芳、焦振寰、陶亮、薛晨旺。
地方标准信息服务平台
1范围
鱼类贝类环境DNA识别技术规范
DBI1/T2023—2022
本文件规定了鱼类贝类环境DNA(eDNA)识别的对象、技术方法、采集和实验分析等技术要求本文件适用于河流、湖泊、水库和渠道等地表水域的鱼类和贝类eDNA识别。2规范性引用文件
下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中,注日期的引用文件,仅该日期对应的版本适用于本文件:不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法SL219水环境监测规范
术语和定义
3
下列术语和定义适用于本文件。3.1
鱼类fish
以鳃呼吸、凭上下颌摄食并通过尾和躯干摆动以及鳍的协调作用游泳的水生脊椎动物,是软骨鱼纲地方标准
和硬骨鱼纲动物的统
3.2
贝类shellfish
信息服务
具三胚层、真体腔的软体动物,为底柄动物中的重要功能类群,主要包括双壳类(如蚌类、贻贝)和腹足类(如螺类)。
3.3
环境DNAenvironnentalDNA(eDNA)从生物生活环境中直接提取到的不同物种DNA的总和,包含动植物脱落前细胞或游离的DNA,可方
提供一个环境中生活物种的存在记录。3.4
聚合酶链式反应polynerasechainreaction(PCR)一种用于扩增特定DNA片段的分子生物学技术,包括变性、退火、延伸等主要步骤。1
DBI1/T2023—2022
3.5
分类操作单元operationaltaxonomicunit(OU)在系统发生学或群体遗传学研究中设定的特定标志,可鉴别生物分类单元(品系、种、属等)。般把碱基序列相似度不小于97%的OTU定义为一个物种。3.6
引物条形码barcode
为高通量测序时区分不同样点来源的物种基因序列,在扩增引物5端增加的序列特异性短片段标记。
4鱼类贝类eDNA识别程序
鱼类贝类eDNA识别程序见图1。
准备工作
非备试剂释几
水样采来
水样拖滤
INA提取
条件优化
地方标准
PCR扩增
测宇
设束样点
结来分析
准信服务平台
大的果录
图1
5试剂和器具
5.1试剂
除非另有说明,试剂均使用符合国家标准的分析纯试剂,试验用水均使用满足GB/T6682中一级水要求的新制备的超纯水。具体要求如下:次氯酸钠:化学纯:
一消毒液:次氯酸钠和蒸馏水配制,有效氯浓度5.5%~6.5%(质量分数):2
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