基本信息
标准号:
DB32/T 1775-2011
中文名称:I型鸭肝炎病毒的检测 RT-PCR方法
所属省份:江苏省地方标准(DB32)
标准状态:现行
发布日期:2011-05-06
实施日期:2011-07-06
出版语种:简体中文
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标准分类号
标准ICS号:65.020.30
中标分类号:B41
标准简介
DB32/T1775-2011标准规范了I型鸭肝炎病毒的RT-PCR分子生物学检测技术,包括引物设计、样品采集、反应条件、操作流程及RNA提取方法,适用于鸭肝脏和病毒尿囊液中I型鸭肝炎病毒的核酸检测。
部分标准内容
DB32/T1775-2011 I型鸭肝炎病毒检测 RT-PCR方法
发布:2011-05-06
实施:2011-07-06
江苏省质量技术监督局发布
前言
为规范I型鸭肝炎病毒分子生物学检测技术,提高检测灵敏度、稳定性和特异性,特制定本标准。本标准按GB/T1.1-2009《标准化工作导则第1部分:标准结构和编写》编制,附录A为规范性附录。本标准由江苏省农业科学院提出,起草单位为江苏省农业科学院,起草人:魏雪涛、李银、刘宇卓、张敬峰。
1 范围
本标准规范了I型鸭肝炎病毒分子生物学检测技术RT-PCR的引物设计、样品范围、操作流程、反应条件等技术标准,适用于检测鸭肝脏和病毒尿囊液中的I型鸭肝炎病毒核酸。
2 规范性引用文件
- GB/T6682-2008 分析实验室用水规格和试验方法
- NY/T541-2002 动物疫病实验室检验采样
3 方法原理
聚合酶链式反应(PCR)是一种用于放大特定DNA片段的分子生物学技术,可视为体外的DNA复制。PCR技术具有快速、敏感和特异性高的优点,广泛应用于动物疫病检测。本标准选取DHV IV P1基因的保守序列,设计特异性引物,并经过PCR条件优化、特异性验证和敏感性测试,对DHV I的鉴定具有高准确性。
4 仪器设备与主要试剂
4.1 仪器设备:PCR仪、离心机、电泳槽、微量移液器、凝胶成像系统。
4.2 主要试剂:TRIZOL、氯仿、异丙醇、无水乙醇、DEPC处理灭菌双蒸水、AMV反转录酶、5×AMV Buffer、10 mmol/L dNTPs、RNA酶抑制剂、25 mmol/L MgCl2、EXTaq DNA聚合酶、10X EXTaq DNA聚合酶buffer、2.5 mmol/L dNTP、DNA Marker DL-2000、琼脂糖。
5 引物
上游引物:5'-ATCTAATGTCCCGATACAAGGTG-3'
下游引物:5'-ACGCTAGTGTTTTGAGTCTAAGGC-3'
6 样品采集
按照NY/T541-2002方法,从病死或扑杀鸭无菌采集肝脏组织。
7 方法步骤
7.1 样品处理
取病料0.5~1 g置研钵中剪碎并研磨,反复冻融研磨,用生理盐水1:5稀释,4℃ 12000 r/min离心10 min,取上清200 μL备用。
阴性对照:未发病正常鸭肝脏。
阳性对照:DHV阳性肝脏样品。
7.2 DHV RNA提取
取已处理样品,每管依次加入Trizol 600 μL,振荡混匀,室温放置10 min,加入氯仿 200 μL,振荡混匀,室温放置1 min,4℃ 12000 r/min离心15 min,取上层水相750 μL,加入500 μL 异丙醇,混匀,-20℃放置15 min,4℃ 12000 r/min离心15 min,去上清,加入75%乙醇1 mL洗涤,4℃ 8000 r/min离心5 min,去上清,室温干燥20 min,加入DEPC水10 μL溶解RNA样品。
7.3 RT-PCR反应
反转录反应:5×AMV Buffer 4 μL、10 mmol/L dNTPs 2 μL、下游引物1 μL、RNA酶抑制剂0.5 μL、RNA模板10 μL、AMV反转录酶0.5 μL、DEPC水 2 μL,总体积20 μL,混匀离心,65℃反应15 min,42℃孵育1 h,95℃ 5 min,同时设阴性、阳性对照,产物-20℃保存。
PCR反应:按25 μL体系进行,含MgCl2 1.5 μL,灭菌水 15 μL,反转录产物 4 μL,10X EXTaq DNA聚合酶buffer 2.5 μL,2 mmol/L dNTP 0.5 μL,上下游引物各 0.5 μL,EXTaq DNA聚合酶 0.5 μL,94℃ 3 min,进入循环:94℃ 30 s,52℃ 30 s,72℃ 30 s,30个循环,72℃延伸10 min。
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