SN/T 1632.3-2013
基本信息
标准号:
SN/T 1632.3-2013
中文名称:出口奶粉中阪崎肠杆菌(克罗诺杆菌属)检验方法 第3部分:荧光PCR方法
标准类别:商检行业标准(SN)
标准状态:现行
出版语种:简体中文
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相关标签:
出口
奶粉
杆菌
检验
方法
荧光
PCR
标准分类号
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出版信息
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标准简介
SN/T 1632.3-2013 出口奶粉中阪崎肠杆菌(克罗诺杆菌属)检验方法 第3部分:荧光PCR方法
SN/T1632.3-2013
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标准内容
中华人民共和国出入境检验检疫行业标准SN/T 1632.3—2013
代替SN/T1632.3—2005
出口奶粉中阪崎肠杆菌(克罗诺杆菌属)检验方法第3部分:荧光PCR方法Determination of Enterobacter sakazakii(Cronobacter spp.)from dehydratedpowdered milk for export-Part 3: Real-time PCR method2013-11-06发布
中华人民共和国
国家质量监督检验检疫总局
2014-06-01实施
SN/T 1632.3—2013
SN/T1632《出口奶粉中阪崎肠杆菌(克罗诺杆菌属)检验方法》共分为3个部分:第1部分:分离与计数;
第2部分:PCR方法;
第3部分:荧光PCR方法。
本部分为SN/T1632的第3部分。
本部分依照GB/T1.12009给出的规则起草。本部分代替SN/T1632.3—2005《奶粉中阪崎肠杆菌检验方法第3部分:荧光PCR方法》。本部分与SN/T1632.3一2005相比,除编辑性修改外,主要技术变化如下:修改了标准的中英文名称;
修改了引物和探针;
删除了定义、术语和缩略语;
增加了克罗诺杆菌属内种的分型鉴别方法的资料性附录。请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任。本部分由国家认证认可监督管理委员会提出并归口。本部分起草单位:中国检验检疫科学研究院、中华人民共和国深圳出入境检验检疫局、中华人民共和国天津出人境检验检疫局。
本部分主要起草人:赵贵明、王、吕敬章、陈颖、杨海荣、赵勇胜、高旗利、张霞、刘培。本部分所代替标准的历次版本发布情况为:SN/T1632.3—2005。
1范围
出口奶粉中阪崎肠杆菌(克罗诺杆菌属)检验方法第3部分:荧光PCR方法SN/T1632.3—2013
SN/T1632的本部分规定了奶粉中阪崎肠杆菌(克罗诺杆菌属)的荧光PCR检测方法。本部分适用手奶粉中版崎肠杆菌(克罗诺杆菌属)的快速定性检测,其他食品可参照执行2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。SN/T1632.1出口奶粉中阪崎肠杆菌(克罗诺杆菌属)检验方法:第1部分:分离与计数SN/T1632.22013出口奶粉中阪崎肠杆菌(克罗诺杆菌属)检验方法第2部分:PCR方法3测定方法
3.1方法提要
奶粉经增菌后,取增菌液1mL加到1.5mL无菌离心管中,以8000r/min的转速离心5min,轻轻倒去上清液,倒置于吸水纸上,吸干液体,不同样品应在吸水纸不同地方吸干;加入50μILDNA提取液(使用前室温解冻并充分混匀,快速吸取),混勾后沸水浴5min,以12000r/min的转速离心5min,取上清液作为模板进行荧光PCR扩增·观察荧光PCR仪的实时曲线,从而对奶粉中的阪崎肠杆菌(克罗诺杆菌属)进行快速检测。
3.2试剂和材料
见SN/T1632.1。除另有规定外,试剂为分析纯或生化试剂.水为灭菌双蒸水3.2.1引物:
5'-GGCGAGCGGCGAATATTAT-3
5-CGGGTTTTCCCAGTTGAGATC-3
3.2.2探针:
5'-FAM-CACCAGTTTTCGGTGCGCCAGC-BHQ-3'3.2.3EaTaqDNA聚合酶。
3.2.4dNTPs:dATP、dTTP、dCTP、dGTP。3.2.5DNA提取试剂:0.1%Chelex100(螯合树脂)水溶液。3.2.610×PCR缓冲液:200mmol/LTris-HCl(pH8.4),200mmol/L氯化钾,15mmol/L氯化镁。FastSartUniversalProbeMaster(2X)。3.2.7
阪崎肠杆菌(克罗诺杆菌属)质控菌株:ATCC29544,或等效菌株。3.2.9
仪器和设备。
荧光PCR仪。
SN/T 1632.3—2013
离心机:20000r/min。
3.2.12移液器:10μL、100μL、200μL、1000μL3.2.13水浴锅。
3.3操作步骤(流程见附录A)
3.3.1前增菌和增菌
取检样100g加人已预热至45℃装有900mL灭菌水的锥形瓶中,振摇使样品充分溶解,36℃士1℃C培养18h~22h。移取1mL转种于10mL改良月桂基硫酸盐胰蛋白陈肉汤中(MLST,见SN/T1632.22013中A.1).36C±1℃培养18h22h。3.3.2模板DNA准备
每瓶培养的MLST分别取1mL加到1.5mL无菌离心管中,8000r/min离心5min,轻轻倒去上清液,倒置于吸水纸上,吸干液体,不同样品应在吸水纸不同地方吸干;加人50uLDNA提取液(使用前室温解冻并充分混匀.快速吸取).混匀后沸水浴5min,12000r/min离心5min,取上清液以待检验(如不能及时检验,可将上清液于一20℃保存)。也可使用其他经验证的DNA提取方法。3.3.3荧光PCR检测
反应体系总体积为25μL.其中含:上游引物和下游引物(10μmol/L)各0.4μL、FastSartUniversalProbeMaster(2X)12.5μL、探针(10μmol/L)0.2μL、模板DNA2μL.ddH,O补齐至25μL。反应步骤:反应步骤一,95℃10min;反应步骤二,95℃5s,55℃退火20s,同时收集荧光信号.共进行40个循环。反应产物可在4℃保存。检测过程中要设阳性对照、阴性对照和空白对照。分别接种阪崎肠杆菌和大肠杆菌到10mLNB中,36℃土1℃过夜培养,各取1.5mL增菌液,离心.提取DNA模板。阪崎肠杆菌DNA模板作阳性对照,大肠杆菌DNA模板作阴性对照,空白对照以无菌水作为模板,加样量与样品加样量一致。
4结果与报告
4.1检测样本C,值小于或等于35.0时.报告阪崎肠杆菌(克罗诺杆菌属)筛选阳性;检测样本C值大于35.0且小于40.0时,重复一次,如果C,值仍小于40.0,且曲线有明显的对数增长期.可报告阪崎肠杆菌(克罗诺杆菌属)筛选阳性,否则报告阪崎肠杆菌(克罗诺杆菌属)未检出;样本检测不到C.值时,报告阪崎肠杆菌(克罗诺杆菌属)未检出。4.2筛选阳性的样本按SN/T1632.1进行确证,必要时参考附录B方法,进一步区分到种4.3报告每100g样品中检出或未检出阪崎肠杆菌(克罗诺杆菌属)。2
附录A
(规范性附录)
荧光PCR检测方法程序
样1001菌然罐水00mm.
36 '±17:,18 h--22 h
[1ml.+10ml.改良月杜苯硫腰盐胰蛋白陈肉激(M-1l.ST肉汤]36c11 t, 18 h --22 h
荧光PC:R检测
克罗诺朴菌显件培养芽
SN/T1632.3—2013
36±,t8h--22h
化人豆蛋琼脂-板(TS.4)
25 : =1,48 h-72 h
氧化悔试验,芊兰氏染件,牛化鉴延程序图
SN/T1632.3-—2013
附录B
(资料性附录)
克罗诺杆菌属内种的分型鉴别方法B.1测试样品基因组DNA的制备
实验菌株纯培养物经36℃24h增菌后,取增菌液1mL加到1.5mL无菌离心管中,以8000r/min的转速离心5min,轻轻倒去上清液,倒置于吸水纸上,吸干液体,不同样品应在吸水纸不同地方吸干:加入50LDNA提取液(使用前室温解冻并充分混匀,快速吸取),混匀后沸水浴5min,以12000r/min的转速离心5min,取上清液作为模板。B.2引物
引物见表B.1。
表B.1克罗诺杆菌recN基因引物
基因名称
B.3聚合酶链式反应
引物序列(5-3°)
F:CTGGCACAATTAACCATCAGTAA
R:TGGGTAACGCACATCACCTGAGT
扩增片段长度/bp
采用表B.1中的引物对检测样品DNA进行PCR扩增。25μLPCR反应体系中,10XPCRbuffen(含Mg+)2.5μLdNTPs(各2.5mol/L)1.0μL,ExTaqDNApolymerase(5U/μL)0.2μL.上下游引物(10μmol/L)各0.5μL,DNA模板2.0μL,加灭菌ddH,O至25μL。PCR循环反应参数为.95℃预变性5min,95℃变性30s,55℃30s.72℃延伸2min30个循环;循环完成后72℃.10min充分延伸,4℃保存。
B.4产物鉴定及测序
配制2%琼脂糖凝胶,取5uμLPCR产物加溴酚蓝混匀,加人合适的DNA分子量标记物,根据电泳槽的长度设定合适的电压进行电泳。凝胶经GelRed染色后,用凝胶成像系统成像,分析PCR反应结果.然后将阳性PCR产物纯化,送至上海生工进行克隆测序。B.5聚类分析
将测序结果拼接后,选取其中的1662bp进行多序列比对,用Mega4.0进行聚类分析。同时以GeneBank上已经公布的克罗诺杆菌属不同种的renN基因序列作为阳性参考:C.dublinensis(EU569474),C.genomospecies1(EU569479),C.muytjensii(EU569492),C.turicensis(EU569523)C.sakazakii(EU569522)、C.malonaticus(EU569491)。4
B.6结果判定
SN/T1632.3—2013Www.bzxZ.net
聚类分析中,将测序结果拼接后,用Lasergene软件选择其中最长的一个ORF1662bp(从起始密码子ATG开始到终止密码子结束),或与参考序列C.dublinensis(EU569474)等比对,截取等长的片段1662bp,与GeneBank中的参考序列进行blast比对,同源性天于97%时,可判断为同一种菌。5
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