SN/T 3757-2013
基本信息
标准号:
SN/T 3757-2013
中文名称:紫羊茅腥黑粉菌检疫鉴定方法
标准类别:商检行业标准(SN)
标准状态:现行
出版语种:简体中文
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黑粉菌
检疫
鉴定
方法
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标准简介
SN/T 3757-2013 紫羊茅腥黑粉菌检疫鉴定方法
SN/T3757-2013
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标准内容
中华人民共和国出入境检验检疫行业标准SN/T3757-—2013
紫羊茅腥黑粉菌检疫鉴定方法
Detection and identification of Tilletia vankyi Carris & Castlebury2013-11-06发布
中华人民共和国
国家质量监督检验检疫总局
2014-06-01实施
本标准按照GB/T1.12009给出的规则起草。本标准由国家认证认可监督管理委员会提出并归口。本标准起草单位:中华人民共和国天津出人境检验检疫局。本标准主要起草人:廖芳、郭京泽、蔡国瑞、罗加凤、刘鹏、刘庭、黄国明SN/T3757-2013
1范围
紫羊茅腥黑粉菌检疫鉴定方法
本标准规定了紫羊茅腥黑粉菌的检疫鉴定方法本标准适用于紫羊茅、黑麦草种子上紫羊茅腥黑粉病菌的检疫鉴定。2规范性引用文件
SN/T3757—2013
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。GB/T18085—2000植物检疫小麦矮化腹黑穗病菌检疫鉴定方法,3病菌基本信息
中文名:紫羊茅腥黑粉菌
学名:TilletiavankyiCarris&Castlebury分类地位:紫羊茅腥黑粉菌属真菌界(Fungi),担子菌门(Basidiomycota),黑粉菌亚门(Ustilaginomycotina),黑粉菌纲(Ustilaginomycetes),腥黑粉菌自(Tilletiales),腥黑粉菌科(Tilletiaceae),腥黑粉菌属(Tilletia)。
传播途径:病原菌在紫羊茅和黑麦草作物抽穗杨花期侵染种脐,在种脐的腹面呈一黑点或沿腹沟形成疤斑,为害严重时整个籽粒充满病菌的冬孢子,主要通过种子作远距离传播。紫羊茅腥黑粉菌的其他信息参见附录A。4方法原理
该病菌的寄主及其菌瘦形态、冬孢子形态特征、PCR反应特性等为鉴定依据。5仪器及用具
5.1仪器
体视显微镜,光学显微镜(带显微照相装置及测微尺)、天平(感量0.1名)、生物安全柜或超净台、低速离心机、往复式振荡器、涡旋振荡器、高压灭菌锅、PCR仪、可调微量加样器、刻度离心管(10mL或20 mL)等。
5.2用具
烧杯、三角瓶、镀子、载玻片、盖玻片、量筒、酒精灯、吸管、Parafilm膜或铝箱纸、离心管(1.5mL)、接种针、PCR管等。
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6主要试剂
次氯酸钠溶液或漂白精片(化学纯)、吐温-20(Tween-20)、席尔氏浮载剂(见GB/T18085—2000附录A中席尔氏浮载剂配制方法)封片剂无灵光显微镜物镜镜头油(Nd=1.516)、琼脂以及PCR试剂氯化钾(KCI)、氯化镁(MgCI)、4种脱氧核糖核酸(dNTPs)、rIaqDNA聚合酶、引物、阳性质粒等。7病原菌鉴定
7.1种子的洗涤检验
7.1.1样品制备
样品接收后在样品预备室内将原始样品在样品袋内混合均匀,制成平均样品7.1.2洗涤离心与定容
称取50g试验样品倒入经灭菌三角瓶中,加灭菌水100mL,再加吐温-201~2滴,用铅箱纸或Parafilm膜封住三角瓶口,将三角瓶置于往复式振荡器上振荡5min,立即将洗涤渡注人灭菌的10mL或20mL离心管内,以1000r/min离心5min,倾去上清液,再加入剩余洗涤悬浮液,离心,直至所有洗涤悬浮液离心完毕,弃上清,取沉淀物。在沉淀物中加入席尔氏浮载剂使之悬浮,视沉淀物多少定容至1mL~3mL
7.1.3镜检
用微量加样器吸取沉淀物悬浮液至载玻片上,加盖玻片制片,制片用沉淀物悬浮液的量以加盖玻片不外溢为准,在光学显微镜下镜检,每份实验样品的离心沉淀物至少检查5张玻片,每片按视野依次全部检查。如发现具网状的腥黑穗病菌冬孢子,应对冬孢子形状、色泽以及不孕细胞(视野中可能没有)的形状、色泽进行观察,并随机测量30个成熟冬抱子的直径网脊高度及一直径上的网自数。5张玻片仍不足30个冬孢子时,再次洗涤样品,直至测量30个孢子。测量应在油镜(100×)下进行,对每个成熟冬孢子按长短轴方向测量直径大小,两者的平均值即为该冬孢子的直径。
2菌瘦检查
将剩余样品倒入白瓷盘内,仔细检查有无菌瘦和病粒(参见附录B),重点检查种子腹沟两侧有无变色或异常。轻度感染的种子表皮上有微小的隆起疱斑,用针刺破常可见黑粉涌出,感病较重的籽粒腹沟侧面表皮下形成黑粉腔,有时延至部分或大部分胚乳,表皮破裂后,露出黑粉。挑取黑粉进行显微镜检查鉴定。
7.3PCR检测
7.3.1冬孢子DNA获取
将6.1.2所获得的沉淀物或菌瘦刺破涂于载玻片上,载玻片上放置1mm见方的灭菌盖玻片,其上滴约0.5μL10×PCRbuffer,体视显微镜下挑取3~10个冬孢子至盖玻片小块上,盖上相似大小的另一块盖玻片,用镊子轻轻按压盖玻片,显微镜下确认孢子破裂后将叠合的两片盖玻片一起放人含4.510XPCRbuffer的PCR管底部。
7.3.2冬孢子套式PCR检测
反应混合液和循环参数及实验方法参见附录C,并测序确认。8鉴定特征
8.1冬孢子及不孕孢形态特征
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紫羊茅腥黑粉病菌冬孢子成熟时呈黄色、红褐色至棕褐色,球形或亚球形,直径18μm~29um(平均23um),表面网状;网脊清晰,较高,1.0um~2.7um,最高可达3.0μm,=直径上网目数为5~9个不孕细胞淡色或无色,透明,直径12μm21um,壁厚0.5um~1.8μm,参见附录B8.2菌瘦形态
菌瘦比种子稍膨大,褐色、黑褐色或黑色,外被一层薄的植物组织,菌瘦易破裂,冬孢子堆呈黑褐色,粉状,参见附录B。
PCR检测
冬孢子DNA经套式PCR扩增,琼脂糖凝胶电泳后成像观察是否出现550bp的目标条带。将目标条带切胶回收并测序确认。
9结果判定
9.1发现菌瘦
发现菌瘦,寄主是紫羊茅或黑麦草,冬孢子形态特征与8.1相符,菌瘦形态与8.2相符,可初步判定为检出紫羊茅腥黑粉病菌,进一步的判定需做冬孢子套式PCR扩增检测。2未发现菌瘦
如果未发现菌瘦,从紫羊茅或黑麦草洗涤液中发现网状冬抱子,冬抱子形态特征与8.1相符,进一步以冬孢子PCR反应结果作判定。9.3冬孢子套式PCR扩增结果判定冬孢子基因组DNA经套式PCR扩增,在琼脂糖凝胶电泳成像观察。阳性DNA应同时出现70Obp和550bp两条目的带,样品管如果同时出现700bp和550bp两条目标带,测定的550bp序列与附录C.2中的序列相似度为99%以上,则视为T.uankyi阳性,携带紫羊茅腥黑粉菌,如果不出现550bp目标带,则视为T.uankyi阴性,不携带紫羊茅腥黑粉菌,如果700bp和550bp两条目标带均未出现,则需重做该实验。
样品保存荐
经鉴定为紫羊茅黑粉菌的样品应按报检号、品种、批号分别存放,置低温干燥处妥善保存6个月,以备接受复核、重复鉴定。保存期满后,需经灭菌处理。3
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茵株保存
将挑抹出来的菌瘦保存于4℃冰箱·保存期满后,需经灭菌处理,将洗涤检验获得的冬孢子制成水久玻片标本。
实验记录保存
要善保存检验报告及实验原始记录。A.1分布
附录A
(资料性附录)
紫羊茅黑粉菌的其他相关信息
已知分布国家有德国、澳大利亚和美国,中国无分布。A.2寄主
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目前已知寄主有黑麦草属的多年生黑麦草(oliumperenneL)、羊茅属的紫羊茅(FestucarubaL.)A.3寄生同一寄主上的近似种
侵染黑麦草(Loliumspp.)的腥黑粉菌有小麦矮化腥黑穗病菌(Tilletiacontroversa,TCK)T.lolii、T.walkeri及T.uankyi,T.walkeri冬孢子具疣状突起,与其他三种黑粉菌易于区分,TCK、T.lolli、T.uankyi,冬孢子胞壁纹饰均为网状,从形态上难以鉴定区分。侵染紫羊茅的腥黑粉菌有雀麦腥黑粉菌(T.bromz)、TCK、小麦网状腥黑穗病菌(T.caries,TCT)、紫羊芽茅腥黑粉菌(T.uankyi)、T.sterilis及T.texana,共6种,其中T.terana冬孢子大小18μm~35μm,淡黄色至透明色,突起圆锥状,表面不成网状,这与冬孢子表面为网状的T.bromi、TCK、TCT、T.vankyi和T.sterilis明显不同。SN/T3757—2013
B.1菌婆形态见图B.1。
附录B
(资料性附录)
菌瘦、冬孢子和不孕孢形态
注;左为菌瘦,中为健康种子,右为带额片的健康种子。图B.1
2冬孢子及不孕孢形态见图B.2。B2
不孕孢
菌瘦与健康种子比较
a)剖面观
注,标尺为10m。
表面观
冬孢子剖面观和表面观,示网脊和网目(100×)c.1引物
C.1.1第一轮引物
通用外套引物:
附录C
(资料性附录)
冬孢子套式PCR扩增
UF:5-GGATGCATTCTGGGGACGT-3'www.bzxz.net
UR:5-GTAGCCTTGTTGCTACGATCTG-3\Tilletiawankyi外套引物:
VF.5TGGAAAGAAGTATCAGAGGATC-3VR:5-CCTGTACTATTCTGACCTCTT-3*C.1.2第二轮引物
通用内套引物:
NUF:5-CACCGCCCAAGCACGTAC-3\NUR:5'-GACCTTTTGGGGTCAAACTTCTC-3扩增片段约为700bp。
T.ucinkyi特异内套引物:
LSNF:5'-CTCCGCCCTTTGCC-3
LSNR.5'-GAGAATAACCTTATGTAATGATTTGA-3扩增片段约为550bp。
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通用外套引物UF/UR和通用内套引物NUF/NUR用于冬孢子的套式扩增,实现对实验过程的质量监测。T.Uankyi外套引物VF/VR和特异内套引物LSNF/LSNR用于冬孢子的套式扩增,实现对T.uamkyi冬孢子的特异检测。
特异引物LSNF/LSNR扩增的目标片段序列CTCCGCCCTTTGCCCGATTATATATAATAAAAAAGCAAATTAAGATAAAAAAAGCCAAGGTAACGTGCTAAGACATAACAACTATAGAAAAAAGAGCGAAATTTTATTAGGCAGGTGGTAAAACCTTTTTTAATATAATGAGGTTTTTTATTATATTTATATAATAAAAAAACAAACGGCATCTTACATAATTTTTTTCTACTTTTTTTATTATTATAAAAAAAGCAAATTAAGATAGAAAAAGGGGAAAGAGGCCGATAAGAAGTTAAGACCTAATATAATAAAGAGAAATTCTCTACCGCTACTCTAGTCCATACCGTATAAATCTGTGTAACCATTAGAGGAAAACAGATTTTAAGTATGTTTATGCCCACAGGCATAAAGTGATTCTAAAAAATCATCGGCAATACAAGTGAAAACGGTCAACGTATATTCGTATAAAGACCGTCGGCAGTCTAAACTGTCGCTACAGACTGGGTCACTTGCGGGTACCTGAAATGGTGCTTAATGTACAGTCGGCTTTCTCTAATGGTCAAATCATTACATAAGGTTATTCTC
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实验方法
C.3.1套式扩增第一轮
C.3.1.1反应体系
冬孢子套式扩增第一轮的反应体系中包含4条引物(UF/UR和VF/VR),扩增模板为排取及破碎的3~10个冬孢子,模板和PCR缓冲液共5μL,添加成分见表C.1,实验设置3个重复,添加无菌水为阴性对照,不设置阳性对照。
C.3.1.2循环参数
热循环参数见表C.1
套式扩增第一轮及第二轮的反应体系及热循环参数表C.1
反应体系
热循环参数
套式扩增第二轮
反应体累
总体积
Buffer
预变性
循环数
终延伸
第一轮
56℃30
94C5min
72C7min
第二轮
每条各0.5μL
每条各0.2μL
第一轮产物1μl
94r15s
72℃40s
反应体系见表C.1,包含4条引物(NUF/NUR和LSNF/LSNR),另以NUF/NUR和LSNF/LSNR扩增片段的阳性质粒为阳性对照,每种质粒的浓度约为40ng/uL,阴性对照为第一轮阴性对照管扩增产物。
循环参数
热循环参数见表C.1。
C.4电泳检测
1.5%琼脂糖凝胶电泳,EB染色并成像观察。8
参考文献
SN/T3757—2013
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