中华人民共和国出入境检验检疫行业标准SN/T4877.10—2017 基因条形码筛查方法 第10部分：检疫性疫霉 DNA barcoding screening method—Part 10: Quarantine Phytophthora 2017-08-29发布 中华人民共和国 国家质量监督检验检疫总局 2018-04-01实施 前言 SN/T4877《基因条形码筛查方法》分为10部分：第1部分：检疫性棒形杆菌；第2部分：检疫性黄单胞菌；第3部分：检疫性植原体；第4部分：检疫性茎点霉；第5部分：检疫性拟茎点霉；第6部分：检疫性嗜酸菌；第7部分：检疫性轮枝菌；第8部分：检疫性炭疽菌；第9部分：检疫性腥黑粉菌；第10部分：检疫性疫霉。本部分为SN/T4877的第10部分，按照GB/T1.1—2009的规则起草。请注意，本文件的某些内容可能涉及专利，本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任。本部分由国家认证认可监督管理委员会提出并归口，由中华人民共和国深圳出入境检验检疫局和深圳市检验检疫科学研究院起草。起草人包括章桂明、高瑞芳、汪莹、程颖慧、王颖、黄河清。 1 范围 本部分规定了栗疫霉黑水病菌、马铃薯疫霉腐病菌、草莓疫霉红心病菌、树莓疫霉根腐病菌、柑橘冬生疫霉、雪松疫霉根腐病菌、首疫霉根腐病菌、菜豆疫霉病菌、栎树猝死病菌、大豆疫霉病菌和丁香疫霉病菌的DNA条形码筛查方法。本部分适用于上述病原菌的DNA条形码序列扩增、分析及结果判定等。 2 规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡注日期的引用文件，仅适用该版本；凡不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有修改单）适用于本文件。引用文件包括：SN/T1131《大豆疫霉病菌检疫鉴定方法》、SN/T1135.6《马铃薯排腐病菌检疫鉴定方法》、SN/T2080、SN/T2474、SN/T2617、SN/T2756、SN/T2759、SN/T3403。 3 术语和定义 下列术语和定义适用于本文件。3.1 DNA条形码（DNA barcode）：生物体内能够代表该物种的标准、具有足够变异、易扩增且相对较短的DNA片段。3.2 线粒体细胞色素C氧化酶亚基I基因（mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I, COI）：线粒体基因变化速率快，COI基因在其13个蛋白编码基因中很少存在插缺失，序列长度500 bp～700 bp，宜作为真菌DNA条形码，是最早提出的DNA条形码片段。3.3 内部转录间隔区序列（J internal transcribed spacer, ITS）：在真核生物中，核糖体DNA由核糖体基因及其相邻的间隔区组成，其序列从5'到3'依次为：外部转录间隔区、18S基因、ITS1、5.8S基因、ITS2、28S基因及基因间隔序列。ITS1和ITS2作为非编码区，受外界环境因素影响较小，与编码区域相比具有较快进化速度，在种内不同菌株间高度保守，而在种间存在较大变化，表现出极大的序列多态性，可提供系统学分析所需的遗传性状。 4 检疫性疫霉基本信息 学名：Phytophthora cambivora（Petri）Buisman，中文名：栗疫霉黑水病菌；学名：Phytophthora erythroseptica Pethybridge，中文名：马铃薯疫霉腐病菌；学名：Phytophthora fragariae Hickman，中文名：草莓疫霉红心病菌；学名：Phytophthora fragariae Hickman var. rubi W.F.Wilcox et J.M.Duncan，中文名：树莓疫霉根腐病菌；学名：Phytophthora hibernalis Carn，中文名：柑橘冬生疫霉；学名：Phytophthora lateralis Tucker et Milbrat，中文名：雪松疫霉根腐病菌。