基本信息
标准号:
SN/T 3687-2013
中文名称:桃X病植原体检疫鉴定方法
标准类别:商检行业标准(SN)
标准状态:现行
出版语种:简体中文
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检疫
鉴定
方法
标准分类号
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出版信息
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标准简介
SN/T 3687-2013.Detection and identification of peach X phytoplasma.
1范围
SN/T 3687规定了植物检疫中桃X病(Peach X disease)的现场检疫和分子生物学鉴定方法。
SN/T 3687适用于进出境桃、油桃、樱桃、李树等种苗中桃X病植原体的检疫鉴定。
2桃X病植原体基本信息
英文名:Peach X phytoplasma
分类地位:细菌界(Bacteria),软壁菌门(Tenericutes),柔膜菌纲(Mollicutes)(又称软球菌纲),非固醇菌原体目(Acholeplasmatales),非固醇菌原体科( Acholeplasmataceae),植原体属( phytoplasma), 16SrIII植原体组。该植原体的地理分布、寄主范围和症状、传播途径及基因组特征等参见附录A。
3方法原理
DAPI染色后的形态学观察为初步筛查方法;以植原体核糖体16SrDNA通用引物进行PCR扩增、测序及限制性内切酶指纹图谱为主要的判定依据。
4主要仪器设备和用具
4.1 仪器设备
PCR仪、荧光显微镜、超净工作台、切片机、电泳仪、凝胶成像分析仪、冷冻离心机、电子天平(1/10 000g)、超低温冰箱、常规冰箱、灭菌锅、pH计、水浴锅、振荡器等
4.2 用具
可调移液器(0μL~20μL、20μL~200μL、200μL~1 000μL)、吸头、研钵、离心管(1.5mL、10mL)、PCR管(0.2 mL).量筒、烧杯、镊子等。
标准内容
中华人民共和国出入境检验检疫行业标准 SN/T3687—2013
桃X病植原体检疫鉴定方法
Detection and identification of peach X phytoplasma
前言
本标准按照GB/T 1.1—2009给出的规则起草。本标准由国家认证认可监督管理委员会提出并归口。
本标准起草单位:中华人民共和国湖北出入境检验检疫局、华中农业大学、中华人民共和国辽宁出入境检验检疫局。
本标准主要起草人:冯汉利、王利平、王振华、洪霓、李金甫、赵晖、曾宪东、王有福。
1 范围
本标准规定了植物检疫中桃X病(Peach X disease)的现场检疫和分子生物学鉴定方法。本标准适用于进出境桃、油桃、樱桃、李树等种苗中桃X病植原体的检疫鉴定。
2 桃X病植原体基本信息
英文名:Peach X phytoplasma
分类地位:细菌界(Bacteria),软壁菌门(Tenericutes),柔膜菌纲(Mollicutes)(又称软球菌纲),非固醇菌原体目(Acholeplasmatales),非固醇菌原体科(Acholeplasmataceae),植原体属(phytoplasma),16SrIII植原体组。该植原体的地理分布、寄主范围和症状、传播途径及基因组特征等参见附录A。
3 方法原理
DAPI染色后的形态学观察为初步筛查方法;以植原体核糖体16SrDNA通用引物进行PCR扩增、测序及限制性内切酶指纹图谱为主要的判定依据。
4 主要仪器设备和用具
4.1 仪器设备
PCR仪、荧光显微镜、超净工作台、切片机、电泳仪、凝胶成像分析仪、冷冻离心机、电子天平(1/10000g)、超低温冰箱、常规冰箱、灭菌锅、pH计、水浴锅、振荡器等。
4.2 用具
可调移液器(0μL~20μL、20μL~200μL、200μL~1000μL)、吸头、研钵、离心管(1.5mL、10mL)、PCR管(0.2mL)、量筒、烧杯、镊子等。
5 主要试剂
5.1 CTAB缓冲液成分:
- CTAB: 2%
- Tris-HCl: 100mmol/L (pH 8.0)
- EDTA: 20mmol/L (pH 8.0)
- 氯化钠(NaCl): 1.4mol/L
- PVP40: 1%
5.2 其他试剂
DAPI染色液、液氮、MgCl2、dNTP、Taq DNA聚合酶、引物等。
6 检疫鉴定方法
6.1 症状检查
观察桃、樱桃、油桃等种苗、果实、叶片等,症状描述参见附录A。
6.2 样品的采集及制备
取有疑似症状的植物的不同部位叶、枝等植物部分进行实验室检测鉴定。
6.3 DAPI染色
选取幼嫩组织(叶脉、侧芽),将叶柄和叶脉固定于5%戊二醛缓冲液中,4℃保存备用。制作切片,切片经0.1mol/L磷酸缓冲液(pH 7.0)冲洗3次;用1μg/mL DAPI溶液染色10min~15min,在460nm激发条件下,通过荧光显微镜观察,在韧皮部筛管部位有明显的蓝色荧光信号表明有植原体存在。
6.4 植原体形态观察
对采集的植物样品制备超薄切片,通过透射电镜观察植原体形态方法(见附录B)。
6.5 植原体通用引物的Nested-PCR扩增、凝胶电泳及序列测定
16SrDNA的扩增使用巢式PCR,第一次PCR扩增使用通用引物为P1/P7,第二次PCR扩增采用通用引物R16F2n/R2;基于引物R16F2n/R2扩增的16SrDNA基因的PCR产物进行凝胶电泳并经测序。具体操作见附录C。
6.6 通用引物扩增产物的RFLP指纹图谱检测
在6.5检测中,若经通用引物R16F2n/R2扩增所得到的序列通过软件进行RFLP图谱分析,具体操作见附录D。
7 结果判定
7.1 症状表现与附录A.3描述一致且DAPI染色观察结果显示蓝色荧光,可初步判定为植原体,但需通过6.5、6.6的方案进一步检测。
7.2 在6.4检测中,电镜超薄切片在韧皮部筛管细胞中存在大量植原体,可初步判定该植物样品携带植原体,需要通过6.5、6.6的方案进一步检测。
7.3 在6.5检测中,若通过通用P1/P7及R16F2n/R2两对引物进行巢式PCR扩增,第二次扩增产物经凝胶电泳检测结果为阳性,且R16F2n/R2扩增产物测序结果经比对,与附录C.4序列一致,则可判定该样品携带桃X病植原体。
7.4 在6.6检测中,通用引物R16F2n/R2扩增产物的RFLP分析片段大小与桃X植原体标准图谱(见图D.1)相符,可判定该样品携带桃X病植原体。
8 样品保存
8.1 样品保存与处理
样品经登记和经手人...
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