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SN/T 5364.1—2021

基本信息

标准号: SN/T 5364.1—2021

中文名称:出口食品中致病菌检测方法微滴式数字PCR法第1部分:副溶血性弧菌

标准类别:商检行业标准(SN)

标准状态:现行

出版语种:简体中文

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相关标签: 出口 食品 致病菌 检测 方法 数字 PCR 溶血性 弧菌

标准分类号

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出版信息

相关单位信息

标准简介

SN/T 5364.1—2021.
1范围
SN/T 5364.1规定了食品中副溶血性弧菌的微滴式数字PCR检测方法。本文件适用于食品中副溶血性弧菌的快速定性检测。
SN/T 5364.1的检出限为1CFU/25 g~5 CFU/25 g(或1 CFU/25 mL~5 CFU/25 mL)。
规范性引用文件
下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中,注日期的引用文件,仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB 4789.7食品安全国家标准惇食品微生物学检验副溶血性弧菌检验GB/T 6682分析实验室用水规格和试验方法
GB/T 27403—2008实验室质量控制规范食品分子生物学检测
3术语和定义
本文件没有需要界定的术语和定义。
4缩略语
下列缩略语适用于本文件。
blaCARB(CARB-type beta-lactamase gene):CARB型β-内酰胺酶编码基因。DNA( deoxyribonuleic acid):脱氧核糖核酸。
ddPCR(droplet digital poly merase chain reaction):微滴式数字PCR。PCR( polymerase chain reaction) :聚合酶链式反应。
5方法原理
针对副溶血性弧菌β-内酰胺酶编码基因(blaCARB)保守序列设计引物,探针,将一定浓度的引物、探针与模板DNA及数字PCR反应预混液混合﹐配成PCR反应体系。将该数字PCR 体系分布到10 000~20 000个微滴中,使大部分微滴中模板DNA分子的数量为1或0,然后进行PCR扩增。

标准图片预览

SN/T 5364.1—2021 出口食品中致病菌检测方法微滴式数字PCR法第1部分:副溶血性弧菌
SN/T 5364.1—2021 出口食品中致病菌检测方法微滴式数字PCR法第1部分:副溶血性弧菌
SN/T 5364.1—2021 出口食品中致病菌检测方法微滴式数字PCR法第1部分:副溶血性弧菌
SN/T 5364.1—2021 出口食品中致病菌检测方法微滴式数字PCR法第1部分:副溶血性弧菌
SN/T 5364.1—2021 出口食品中致病菌检测方法微滴式数字PCR法第1部分:副溶血性弧菌

标准内容

ICS07.100.30
CCSW04
中华人民共和国出入境检验检疫行业标准SN/T5364.1—2021
出口食品中致病菌检测方法
微滴式数字PCR法
第1部分:副溶血性弧菌
专业标准信息服务平台
Droplet digital PCR method for detection of pathogens in export food-Partl:Vibrioparahaemolyticus2021-11-22发布
2022-06-01实施
中华人民共和国海关总署
SN/T5364.1—2021
本文件按照GB/T1.1一2020《标准化工作导则第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定起草。
微滴式数字PCR法》共分为8个部分:SN/T53642021《出口食品中致病菌检测方法第1部分:副溶血性弧菌;
第2部分:霍乱弧菌;
第3部分:溶藻弧菌;
第4部分:创伤弧菌;
第5部分:金黄色葡萄球菌:
第6部分:单核细胞增生李斯特氏菌;第7部分:产志贺毒素大肠埃希氏菌;第8部分:克罗诺杆菌属(阪崎肠杆菌)。本文件为SN/T5364一2021的第1部分。为准
请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别专利的责任。本文件由中华人民共和国海关总署提出并归口。本文件起草单位:中国海关科学技术研究中心、中国检验检疫科学研究院、中华人民共和国天津海关。
本文件主要起草人:曾静、魏海燕、马丹、魏咏新、李丹、徐蕾蕊、张西萌、王紫薇、董志珍、高飞、赵良娟、邢仕歌。
1范围
出口食品中致病菌检测方法
微滴式数字PCR法
第1部分:副溶血性弧菌
本文件规定了食品中副溶血性弧菌的微滴式数字PCR检测方法。本文件适用于食品中副溶血性弧菌的快速定性检测。SN/T5364.1—2021
本文件的检出限为1CFU/25g~5CFU/25g(或1CFU/25mL~5CFU/25mL)。2规范性引用文件
下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中,注日期的引用文件,仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB4789.7食品安全国家标准食品微生物学检验副溶血性弧菌检验GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法GB/T27403一2008实验室质量控制规范食品分子生物学检测术语和定义
行业标
本文件没有需要界定的术语和定义,4wwW.bzxz.Net
缩略语
下列缩略语适用于本文件。
服务务
blaCARB(CARB-typebeta-lactamasetee):CARB型β-内酰胺酶编码基因。DNA(deoxyribonuleicacid):脱氧核糖核酸。ddPCR(dropletdigitalpolymerasechainreaction)微式数字PCR。5方法原理
针对副溶血性弧菌β-内酰胺酶编码基因(bLaCARB)保守序列设计引物、探针,将一金浓度的引物、探针与模板DNA及数字PCR反应预混液混合,配成PCR反应体系。将该数字PCR体系分布到10000~20000个微滴中,使大部分微滴中模板DNA分子的数量为1或0,然后进行PCR扩增。blaCARB基因探针5端标记FAM荧光基团,利用数字PCR系统的检测通道,可对每个微滴的荧光信号进行采集分析。含有模板DNA的微滴出现荧光信号的增强,形成阳性微滴簇。最终根据阳性微滴的有无判定样品中是否含有副溶血性弧菌。1
SN/T5364.1—2021
6主要设备及耗材
6.1天平:感量0.1g。
6.2均质器。
6.3恒温培养箱:36℃±1℃。
6.4高速台式冷冻离心机(离心力12000g)。6.5涡旋振荡仪。
6.6核酸蛋白分析仪或紫外分光光度计。6.7生物安全柜。
6.8ddPCR扩增仪及相关配套设备。6.9不同量程移液器:100u~1000uL20uL~200、10L~100、0.5μ~106.10
离心管:2mL、1.5mL和0.2mL。
材料与试剂
文本为准
7.1仅使用分析纯试剂和符合GB/T6682规定的一级水。7.2细菌基因组提取试剂盒。
7.3ddPCR反应配套试剂。
7.4去游离核酸酶:伯乐1)
7.5阳性对照:副溶血性弧菌标准菌株DNA,或含目的片段的DNA亦可。7.6副溶血性弧菌β-内酰胺酶编码基因(bLaCARB)特异性序列片段参见附录A,引物探针如下:VP-F:5′-GTGAAGCCGCCATGTTGAT-3VP-R:5\-GACCACCAATTTCATTTAGCACTAAG-3';VP-P:5-FAM-AGCGACAACACCGCCGCGA-BHQ1-3'。8检测程序
标准信息服务平台
食品中副溶血性弧菌ddPR检测理序见图1。1)给出这一信息是为了方便本文件使用者,并不表示只认可该产品。如果其他等效产品具有相同的效果,则可使用等效产品。
待测样品
参照(B4789.7进行样品制备和增菌细菌INA提取
daPcR 反应
结果观察
传统方法硝认
正式出放
食品中副溶血性弧菌ddPCR检测程序图1
实验操作步骤
样品制备
参照GB4789.7方法进行样品制备和增菌。9.2
DNA提取
SN/T5364.1—2021
直接取9.1获得的增菌液2ml加到无菌离心管中,8000g离心2min,尽量吸弃上清:利用100uL磷酸盐缓冲液重悬沉淀,加入20u游离核酸酶,置于37℃作用15min~30min,95℃加热10min使酶失活。继而利用细菌基因组提取试剂盒提取DNA,操作方法按试剂盒说明书进行。9.3DNA浓度和纯度测定
取适量DNA原液加双蒸水稀释一定倍数后,使用核酸蛋白分所仪或案外分光光度计测定260nm和280nm处的吸收值,按照式(1)计算DNA的浓度。p=A2seXNX50
....(1)
SN/T 5364.1—2021
式中:
DNA浓度,单位为微克每毫升(μg/mL);A260
260nm处的吸光值;
核酸稀释倍数
当DNA浓度为0.1μg/mL~100μg/mL.A26/A280在1.8~2.0之间时,适用ddPCR检测。9.4ddPCR检测
9.4.1对照和平行
检测过程中分别设置阳性对照、阴性对照和空白对照。以副溶血性弧菌标准菌株DNA或含目的片段的DNA作为阳性对照:利用细菌基因组提取试剂盒按步骤9.2提取的大肠埃希氏菌标准菌株DNA作为阴性对照:用等体积的双蒸水代替DNA模板作为空白对照。每个待检样品提取的DNA溶液进行3个平行ddPCR检测。
反应体系
按照表1配制反应体系。
试剂名称
数字PCR反应预混液
DNA模板
体系总体积
微滴生成
表1ddPCR反应体系
储备液浓度
10 μmol/L
10μmol/L
10μmol/L
电终浓度
0.75μmol/L
0.75μmol/L
0.25gμmol/L
将配制好的ddPCR反应混合液,加人微布生成装置加样孔中,按仪器操作说明生成微滴。9.4.4ddPCR扩增
将生成的微滴缓慢转移至96孔板中,封膜后置于PCR仪上以下参数进行PCR扩增:95℃10min(升降温速度:1℃/s);94℃30s(升降温速度:1℃/s),0001mir/升降温速度:1℃/s),45个循环:98℃10min(升降温速度:1℃/s),4℃保存反应产物。注:PCR反应参数可根据基因扩增仪型号的不同进行适当的调整9.4.5荧光信号读取
扩增反应结束后,将96孔板放人ddPCR检测仪中对每个微滴进行荧光检测,采用FAM通道读取荧光信号。
10结果分析与表述
阐值的设定
SN/T5364.1—2021
根据空白对照的终点荧光值设定阈值限,阈值限应对空白和阳性扩增结果进行明确的区分。质量控制
体系分隔产生的有效微滴的总数量满足所用ddPCR仪器型号要求。10.2.2
阴性对照和空白对照无荧光信号检出。10.2.3阳性对照有荧光信号检出且阴性微滴簇与阳性微滴簇能够截然分开。10.2.4以上质控条件有一项不符合者,实验结果视为无效,查找原因后再次进行ddPCR检测10.3结果表述
10.3.1待检样品所有微滴的荧光信号均低于阅值限,待测样品中不含有副溶血性弧菌,检测结果表述为“未检出副溶血性弧菌”。
10.3.2待检样品3个平行中至少1个平行有荧光信号高于阅值限的阳性微滴,且阴性微滴簇与阳性版文本
微滴簇能够截然分开,该样品结果为副溶血性弧菌初筛阳性,对样品的增菌液进一步按GB4789.7中的操作步骤进行确认后报告结果。11
防污染措施
检测过程中防止交叉污染的措施按照GB/T27403-3一2008中附录D的规定执行
SN/T5364.1—2021
附录A
(资料性)
副溶血性弧菌特异性基因序列片段副溶血性弧菌blaCARB基因序列(部分)及引物设计示意图(AccessionNo.NG_048735.1)见图A.1
Bcl atggataaas teecagancn aagncacgt ategaaary cttytgaags sgeeatgttg36l aleagcgaca acaaaeaaoa eaan-ag-g o.aaa.gaaa..gg-ggla: laaagaggla421 aeaetgtttt tgegctctat tgogaeaaa gcaacgcgac ttgaccgatt ggagccccgt图A.1副溶血性弧菌blaCARB基因序列(部分)及引物设计示意图注:阴影部分分别为上下游引物序列,方框部分为探针序列。SN/T 5364. 1-202
中华人民共和国出入境检验检疫行业标准
出口食品中致病菌检测方法
微滴式数字PCR法
第1部分:副溶血性弧菌
SN/T5364.12021
中国海关出版社有限公司出版发行市朝阳区东四环南路甲1号(100023)编码部:(010)65194242-7509
网nchpto.nskb.com/book
中国标准出版社秦皇岛印刷厂印刷开本880×12301/16印张0.75字数22千字2022年6月第一版
2022年6月第一次印刷
印数1—500
书号:155175·731
定价12.00元
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